Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HIRIP3Q9BW71 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
HIRIP3Q9BW71 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HIRIP3Q9BW71 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms