Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

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Length 2,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NOTCH4Q99466 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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