Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SLC4A9Q96Q91 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms