Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNGAP1Q96PV0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNGAP1Q96PV0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms