Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms