Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GJD4Q96KN9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GJD4Q96KN9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms