Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHISA4Q96DD7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHISA4Q96DD7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms