Protein–RNA interactions for Protein: Q92393

TY1B-OR, Transposon Ty1-OR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-ORQ92393 ARO7YPR060C 771 nt2.6□□□□□ -1.99
TY1B-ORQ92393 snR37snR37 386 nt2.6□□□□□ -1.99
TY1B-ORQ92393 VPS8YAL002W 3825 nt2.6□□□□□ -1.99
TY1B-ORQ92393 YML096WYML096W 1578 nt2.59□□□□□ -1.99
TY1B-ORQ92393 PEX10YDR265W 1014 nt2.59□□□□□ -1.99
TY1B-ORQ92393 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt2.59□□□□□ -1.99
TY1B-ORQ92393 MSS116YDR194C 1995 nt2.59□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 ECM13YBL043W 774 nt2.59□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 PSD2YGR170W 3417 nt2.58□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 CAB2YIL083C 1098 nt2.58□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 ATG29YPL166W 642 nt2.58□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 APL2YKL135C 2181 nt2.57□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 SPS18YNL204C 903 nt2.57□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 PDR17YNL264C 1053 nt2.57□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 BTS1YPL069C 1008 nt2.57□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 YRB30YGL164C 1323 nt2.57□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 MGA2YIR033W 3342 nt2.57□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 MET6YER091C 2304 nt2.57□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 YDR239CYDR239C 2364 nt2.57□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 VPS16YPL045W 2397 nt2.57□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 IBD2YNL164C 1056 nt2.56□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 AIM39YOL053W 1188 nt2.56□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 SEC7YDR170C 6030 nt2.56□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 LRE1YCL051W 1752 nt2.56□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 YKL075CYKL075C 1353 nt2.56□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 YDR203WYDR203W 318 nt2.56□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 ERV29YGR284C 933 nt2.56□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 YJR111CYJR111C 852 nt2.56□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 GCD7YLR291C 1146 nt2.56□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 NET1YJL076W 3570 nt2.56□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 CSI1YMR025W 888 nt2.55□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 SMC1YFL008W 3678 nt2.55□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 YNL144CYNL144C 2223 nt2.54□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 RTT102YGR275W 474 nt2.54□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 YML090WYML090W 387 nt2.54□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 CDC31YOR257W 486 nt2.54□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 HAT1YPL001W 1125 nt2.54□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 YOR365CYOR365C 2112 nt2.54□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 GGA1YDR358W 1674 nt2.54□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 TMA22YJR014W 597 nt2.54□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 MRPL17YNL252C 846 nt2.54□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 ORC4YPR162C 1590 nt2.54□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 BUD6YLR319C 2367 nt2.53□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 YFH1YDL120W 525 nt2.53□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 SDT1YGL224C 843 nt2.53□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 MRPS17YMR188C 714 nt2.53□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 IMH1YLR309C 2736 nt2.53□□□□□ -2
TY1B-ORQ92393 POL2YNL262W 6669 nt2.53□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 RTP1YMR185W 2946 nt2.52□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 VMA8YEL051W 771 nt2.52□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 YJL028WYJL028W 336 nt2.52□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 CWC24YLR323C 780 nt2.52□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 PAC1YOR269W 1485 nt2.51□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 YMR141CYMR141C 309 nt2.51□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 YOL079WYOL079W 399 nt2.51□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 ROY1YMR258C 1662 nt2.51□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 YDL242WYDL242W 354 nt2.51□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 YER068C-AYER068C-A 432 nt2.51□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 GEA1YJR031C 4227 nt2.51□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 STE12YHR084W 2067 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 PHS1YJL097W 654 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 CAP1YKL007W 807 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 PZF1YPR186C 1290 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 ARL1YBR164C 552 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 SEC16YPL085W 6588 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 CDC60YPL160W 3273 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 SOK2YMR016C 2358 nt2.49□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 KRE2YDR483W 1329 nt2.49□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 MSH5YDL154W 2706 nt2.49□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 IRC10YOL015W 1761 nt2.49□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 COG4YPR105C 2586 nt2.49□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 YPR203WYPR203W 309 nt2.49□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 MOT1YPL082C 5604 nt2.48□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 PAU2YEL049W 363 nt2.48□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 PAU12YGR294W 363 nt2.48□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 PAU18YLL064C 363 nt2.48□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 NSE1YLR007W 1011 nt2.48□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 PAU6YNR076W 363 nt2.48□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 SIL1YOL031C 1266 nt2.48□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 PAU24YBR301W 363 nt2.48□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 HSL1YKL101W 4557 nt2.47□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 REC114YMR133W 1287 nt2.47□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 TPS2YDR074W 2691 nt2.47□□□□□ -2.01
TY1B-ORQ92393 CYR1YJL005W 6081 nt2.46□□□□□ -2.02
TY1B-ORQ92393 TUS1YLR425W 3924 nt2.46□□□□□ -2.02
TY1B-ORQ92393 STD1YOR047C 1335 nt2.46□□□□□ -2.02
TY1B-ORQ92393 YPR117WYPR117W 7470 nt2.46□□□□□ -2.02
TY1B-ORQ92393 YDR401WYDR401W 564 nt2.46□□□□□ -2.02
TY1B-ORQ92393 PDP3YLR455W 915 nt2.46□□□□□ -2.02
TY1B-ORQ92393 YNL165WYNL165W 1221 nt2.46□□□□□ -2.02
TY1B-ORQ92393 YOR114WYOR114W 885 nt2.46□□□□□ -2.02
TY1B-ORQ92393 RPS30BYOR182C 192 nt2.46□□□□□ -2.02
TY1B-ORQ92393 SKT5YBL061C 2091 nt2.45□□□□□ -2.02
TY1B-ORQ92393 YDL118WYDL118W 381 nt2.45□□□□□ -2.02
TY1B-ORQ92393 CDC123YLR215C 1083 nt2.45□□□□□ -2.02
TY1B-ORQ92393 YML053CYML053C 639 nt2.45□□□□□ -2.02
TY1B-ORQ92393 YOR097CYOR097C 528 nt2.45□□□□□ -2.02
TY1B-ORQ92393 PHO13YDL236W 939 nt2.44□□□□□ -2.02
TY1B-ORQ92393 YPR1YDR368W 939 nt2.44□□□□□ -2.02
TY1B-ORQ92393 YJR023CYJR023C 402 nt2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 35.3 ms