Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P6

LRRC71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71Q8N4P6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC71Q8N4P6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC71Q8N4P6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms