Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRINP3Q76B58 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRINP3Q76B58 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms