Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP50Q70EL3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP50Q70EL3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
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