Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC171Q6TFL3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC171Q6TFL3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms