Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
CARMIL2Q6F5E8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CARMIL2Q6F5E8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CARMIL2Q6F5E8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms