Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
USPL1Q5W0Q7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
USPL1Q5W0Q7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms