Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TWISTNBQ3B726 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TWISTNBQ3B726 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms