Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UVSSAQ2YD98 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UVSSAQ2YD98 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms