Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPE65Q16518 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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