Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3CQ15386 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
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