Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TTF1Q15361 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTF1Q15361 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
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