Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFRLQ15198 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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