Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BRD3Q15059 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRD3Q15059 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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