Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
IRF5Q13568 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF5Q13568 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
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