Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.56■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms