Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC15Q0P6D6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms