Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIPPLY1Q0D2K3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms