Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 CGR1YGL029W 363 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 TAM41YGR046W 1158 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 PPX1YHR201C 1194 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 YAL004WYAL004W 648 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 TPK3YKL166C 1197 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 NNT1YLR285W 786 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 FLD1YLR404W 858 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 SHH3YMR118C 591 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 YMR187CYMR187C 1296 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 IZH2YOL002C 954 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 MCA1YOR197W 1299 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 RPN2YIL075C 2838 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 MIP6YHR015W 1980 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 GSC2YGR032W 5688 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 VPS9YML097C 1356 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt3.24□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt3.24□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt3.24□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 URA2YJL130C 6645 nt3.24□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt3.24□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 YCL020WYCL020W 1317 nt3.24□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 PIN4YBL051C 2007 nt3.24□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 VID27YNL212W 2349 nt3.24□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 NSP1YJL041W 2472 nt3.24□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 TGL2YDR058C 981 nt3.24□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 YGL152CYGL152C 678 nt3.24□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 YIP1YGR172C 747 nt3.24□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.24□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 YAR070CYAR070C 300 nt3.24□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 YBL028CYBL028C 321 nt3.24□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 MIX23YBL107C 591 nt3.24□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 TUM1YOR251C 915 nt3.24□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 BMS1YPL217C 3552 nt3.24□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 AEP1YMR064W 1557 nt3.24□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 SLA1YBL007C 3735 nt3.24□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 ISM1YPL040C 3009 nt3.24□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 YLR177WYLR177W 1887 nt3.24□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 RDS1YCR106W 2499 nt3.24□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 GPI1YGR216C 1830 nt3.23□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 YCR085WYCR085W 354 nt3.23□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 NRP1YDL167C 2160 nt3.23□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 SLU7YDR088C 1149 nt3.23□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 TMA20YER007C-A 546 nt3.23□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 YFL065CYFL065C 309 nt3.23□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 YGR293CYGR293C 462 nt3.23□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 STE18YJR086W 333 nt3.23□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt3.23□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 AEP2YMR282C 1743 nt3.23□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 SQS1YNL224C 2304 nt3.23□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 MPP6YNR024W 561 nt3.23□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 YBR300CYBR300C 498 nt3.23□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 FAS1YKL182W 6156 nt3.23□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 MIG3YER028C 1185 nt3.22□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt3.22□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt3.22□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 YIL082WYIL082W 873 nt3.22□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 YKR051WYKR051W 1257 nt3.22□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 RLP24YLR009W 600 nt3.22□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 BUR2YLR226W 1188 nt3.22□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 INP1YMR204C 1263 nt3.22□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 ASI2YNL159C 870 nt3.22□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 ARF3YOR094W 552 nt3.22□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt3.22□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 JID1YPR061C 906 nt3.22□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 EBS1YDR206W 2655 nt3.22□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 PSP1YDR505C 2526 nt3.21□□□□□ -1.9
SSK1Q07084 DIG2YDR480W 972 nt3.21□□□□□ -1.9
SSK1Q07084 RPS8BYER102W 603 nt3.21□□□□□ -1.9
SSK1Q07084 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt3.21□□□□□ -1.9
SSK1Q07084 YJR087WYJR087W 351 nt3.21□□□□□ -1.9
SSK1Q07084 PBA1YLR199C 831 nt3.21□□□□□ -1.9
SSK1Q07084 YAR069CYAR069C 294 nt3.21□□□□□ -1.9
SSK1Q07084 YLR456WYLR456W 615 nt3.21□□□□□ -1.9
SSK1Q07084 GIM5YML094W 492 nt3.21□□□□□ -1.9
SSK1Q07084 ERG2YMR202W 669 nt3.21□□□□□ -1.9
SSK1Q07084 RPS8AYBL072C 603 nt3.21□□□□□ -1.9
SSK1Q07084 INN1YNL152W 1230 nt3.21□□□□□ -1.9
SSK1Q07084 DPB3YBR278W 606 nt3.21□□□□□ -1.9
SSK1Q07084 MSD1YPL104W 1977 nt3.21□□□□□ -1.9
SSK1Q07084 MFB1YDR219C 1398 nt3.21□□□□□ -1.9
SSK1Q07084 IMH1YLR309C 2736 nt3.21□□□□□ -1.9
SSK1Q07084 RRN6YBL014C 2685 nt3.2□□□□□ -1.9
SSK1Q07084 ALG8YOR067C 1734 nt3.2□□□□□ -1.9
SSK1Q07084 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt3.2□□□□□ -1.9
SSK1Q07084 YDR431WYDR431W 312 nt3.2□□□□□ -1.9
SSK1Q07084 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt3.2□□□□□ -1.9
SSK1Q07084 PRE1YER012W 597 nt3.2□□□□□ -1.9
SSK1Q07084 BRR6YGL247W 594 nt3.2□□□□□ -1.9
SSK1Q07084 DSE2YHR143W 978 nt3.2□□□□□ -1.9
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