Protein–RNA interactions for Protein: Q06835

RDS3, Pre-mRNA-splicing factor RDS3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3Q06835 RPL13BYMR142C 600 nt2.2□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 MIC27YNL100W 705 nt2.2□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 YOR366WYOR366W 354 nt2.2□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 YPR053CYPR053C 456 nt2.2□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 PEX34YCL056C 435 nt2.2□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 TCB2YNL087W 3537 nt2.2□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 DBP10YDL031W 2988 nt2.2□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 BUD4YJR092W 4344 nt2.2□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 CIN1YOR349W 3045 nt2.2□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 MSB2YGR014W 3921 nt2.2□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 SAD1YFR005C 1347 nt2.19□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 ROG1YGL144C 2058 nt2.19□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 RPN2YIL075C 2838 nt2.19□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 CAF120YNL278W 3183 nt2.19□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 NSA2YER126C 786 nt2.19□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 YGL242CYGL242C 546 nt2.19□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 UPF3YGR072W 1164 nt2.19□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 RPS23AYGR118W 438 nt2.19□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt2.19□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 NNF1YJR112W 606 nt2.19□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 PHD1YKL043W 1101 nt2.19□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 YAL066WYAL066W 309 nt2.19□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 YLR169WYLR169W 354 nt2.19□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 NNT1YLR285W 786 nt2.19□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 YAR070CYAR070C 300 nt2.19□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 RIM9YMR063W 720 nt2.19□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 RHO5YNL180C 996 nt2.19□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 RPS23BYPR132W 438 nt2.19□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 SPT14YPL175W 1359 nt2.19□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 APC5YOR249C 2058 nt2.19□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 POL2YNL262W 6669 nt2.19□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 FAS1YKL182W 6156 nt2.18□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 TLC1TLC1 1301 nt2.18□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 YJR030CYJR030C 2238 nt2.18□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 snR68snR68 136 nt2.18□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 RUB1YDR139C 234 nt2.18□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 MFA1YDR461W 111 nt2.18□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 COBQ0105 1158 nt2.18□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 HMF1YER057C 390 nt2.18□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 RPL23BYER117W 414 nt2.18□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 LIF1YGL090W 1266 nt2.18□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 YGL218WYGL218W 651 nt2.18□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 ERG25YGR060W 930 nt2.18□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 SVP26YHR181W 687 nt2.18□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt2.18□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 RPC37YKR025W 849 nt2.18□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 AAR2YBL074C 1068 nt2.18□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt2.18□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 PPT2YPL148C 522 nt2.18□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 CUP9YPL177C 921 nt2.18□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 SCD6YPR129W 1050 nt2.18□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 APD1YBR151W 951 nt2.18□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 YLR278CYLR278C 4026 nt2.18□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 YKL222CYKL222C 2118 nt2.18□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 VBA4YDR119W 2307 nt2.18□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 IRC3YDR332W 2070 nt2.18□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 YDL180WYDL180W 1644 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 PEX6YNL329C 3093 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 FUN30YAL019W 3396 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 YCR100CYCR100C 951 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 PEX10YDR265W 1014 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 GUK1YDR454C 564 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 OST5YGL226C-A 261 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 YGR018CYGR018C 330 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 VMA7YGR020C 357 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 YGR039WYGR039W 312 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 YGR073CYGR073C 372 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 YHL005CYHL005C 393 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 PPX1YHR201C 1194 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 RPA12YJR063W 378 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 SDH3YKL141W 597 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 SFH1YLR321C 1281 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 YLR400WYLR400W 474 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 SPC2YML055W 537 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 COX14YML129C 213 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 YNL013CYNL013C 378 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 HHF2YNL030W 312 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 YOR062CYOR062C 807 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 VAM10YOR068C 345 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 MCA1YOR197W 1299 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 TUM1YOR251C 915 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 HEH2YDR458C 1992 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 FLO1YAR050W 4614 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 PSP1YDR505C 2526 nt2.17□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 JJJ1YNL227C 1773 nt2.16□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 TVP15YDR100W 432 nt2.16□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 THO1YER063W 657 nt2.16□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 COG7YGL005C 840 nt2.16□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 RSM27YGR215W 333 nt2.16□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 YIL169CYIL169C 2988 nt2.16□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt2.16□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 VMA5YKL080W 1179 nt2.16□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 YNL184CYNL184C 327 nt2.16□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 RSM19YNR037C 276 nt2.16□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 YOL114CYOL114C 609 nt2.16□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 YOR238WYOR238W 912 nt2.16□□□□□ -2.06
RDS3Q06835 SRL1YOR247W 633 nt2.16□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 41.4 ms