Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT17Q04695 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms