Protein–RNA interactions for Protein: Q04006

UPS3, Protein UPS3, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPS3Q04006 SLP1YOR154W 1764 nt2.05□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 TOF1YNL273W 3717 nt2.05□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 snR57snR57 88 nt2.05□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 IRC6YFR043C 714 nt2.05□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 YGR039WYGR039W 312 nt2.05□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 EPT1YHR123W 1176 nt2.05□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 GTT1YIR038C 705 nt2.05□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 YAL069WYAL069W 315 nt2.05□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 RAD10YML095C 633 nt2.05□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 RPL19BYBL027W 570 nt2.05□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 YBL081WYBL081W 1107 nt2.05□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 snR11snR11 258 nt2.05□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 YOR062CYOR062C 807 nt2.05□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 YPL035CYPL035C 348 nt2.05□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 VPS28YPL065W 729 nt2.05□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 BTS1YPL069C 1008 nt2.05□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 PIS1YPR113W 663 nt2.05□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 PIN3YPR154W 648 nt2.05□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 IRA2YOL081W 9240 nt2.05□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 VPS13YLL040C 9435 nt2.05□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 MON1YGL124C 1935 nt2.05□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 GYL1YMR192W 2163 nt2.05□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 ECM18YDR125C 1362 nt2.04□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 HTA1YDR225W 399 nt2.04□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt2.04□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 CIR1YGR207C 786 nt2.04□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 YLR076CYLR076C 423 nt2.04□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 JIP3YLR331C 378 nt2.04□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 YMR087WYMR087W 855 nt2.04□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 NEW1YPL226W 3591 nt2.04□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 ARP8YOR141C 2646 nt2.04□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 YML096WYML096W 1578 nt2.03□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 BNI4YNL233W 2679 nt2.03□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 HMF1YER057C 390 nt2.03□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 NSA2YER126C 786 nt2.03□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 RPL15AYLR029C 615 nt2.03□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 YML037CYML037C 1023 nt2.03□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 YBL028CYBL028C 321 nt2.03□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 RIM9YMR063W 720 nt2.03□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 YNR062CYNR062C 984 nt2.03□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 DSF2YBR007C 2211 nt2.03□□□□□ -2.08
UPS3Q04006 DNL4YOR005C 2835 nt2.03□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 YPL150WYPL150W 2706 nt2.03□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 HFM1YGL251C 3564 nt2.03□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 PSY2YNL201C 2577 nt2.03□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 RDS2YPL133C 1341 nt2.02□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 RRP42YDL111C 798 nt2.02□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.02□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.02□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.02□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 YGR073CYGR073C 372 nt2.02□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 YNL203CYNL203C 612 nt2.02□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 COS1YNL336W 1146 nt2.02□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 APD1YBR151W 951 nt2.02□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 RGR1YLR071C 3249 nt2.02□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 DUN1YDL101C 1542 nt2.01□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 YDL050CYDL050C 372 nt2.01□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 RDI1YDL135C 609 nt2.01□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 RPB9YGL070C 369 nt2.01□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.01□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 MRPL38YKL170W 417 nt2.01□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 BET3YKR068C 582 nt2.01□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.01□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 MPD2YOL088C 834 nt2.01□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 ARF3YOR094W 552 nt2.01□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 YOR097CYOR097C 528 nt2.01□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 VMA9YCL005W-A 222 nt2.01□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 PLM2YDR501W 1566 nt2.01□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 TOR1YJR066W 7413 nt2.01□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 PCL2YDL127W 927 nt2□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 NSE3YDR288W 912 nt2□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 YGL101WYGL101W 648 nt2□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 TAN1YGL232W 870 nt2□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 PEX4YGR133W 552 nt2□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 YHR097CYHR097C 1101 nt2□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 YJR128WYJR128W 360 nt2□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 YLR339CYLR339C 552 nt2□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 STH1YIL126W 4080 nt2□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 SVL3YPL032C 2478 nt2□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 YKL100CYKL100C 1764 nt2□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 SEC16YPL085W 6588 nt2□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 RED1YLR263W 2484 nt1.99□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 YCK2YNL154C 1641 nt1.99□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 snR63snR63 255 nt1.99□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 IZH1YDR492W 951 nt1.99□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 DAD2YKR083C 402 nt1.99□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 ILV5YLR355C 1188 nt1.99□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 PSY3YLR376C 729 nt1.99□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt1.99□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 YNL043CYNL043C 321 nt1.99□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 YBR209WYBR209W 318 nt1.99□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 YDR186CYDR186C 2634 nt1.99□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 SLI1YGR212W 1407 nt1.99□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 YOL098CYOL098C 3114 nt1.98□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 PDR1YGL013C 3207 nt1.98□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 CTH1YDR151C 978 nt1.98□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 MCM21YDR318W 1107 nt1.98□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 LRS4YDR439W 1044 nt1.98□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 RPL27BYDR471W 411 nt1.98□□□□□ -2.09
UPS3Q04006 DUO1YGL061C 744 nt1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.1 ms