Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLOD1Q02809 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLOD1Q02809 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms