Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMAD3P84022 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms