Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp2P63044 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp2P63044 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms