Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC4P56524 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC4P56524 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC4P56524 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC4P56524 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC4P56524 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC4P56524 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC4P56524 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC4P56524 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC4P56524 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC4P56524 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC4P56524 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC4P56524 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC4P56524 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC4P56524 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC4P56524 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDAC4P56524 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms