Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATMP50440 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATMP50440 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATMP50440 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATMP50440 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GATMP50440 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATMP50440 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATMP50440 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATMP50440 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATMP50440 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATMP50440 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATMP50440 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATMP50440 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATMP50440 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATMP50440 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATMP50440 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATMP50440 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATMP50440 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATMP50440 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATMP50440 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATMP50440 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATMP50440 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATMP50440 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GATMP50440 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATMP50440 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATMP50440 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATMP50440 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATMP50440 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATMP50440 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATMP50440 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATMP50440 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GATMP50440 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATMP50440 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATMP50440 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATMP50440 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATMP50440 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATMP50440 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATMP50440 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GATMP50440 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GATMP50440 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GATMP50440 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GATMP50440 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GATMP50440 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GATMP50440 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GATMP50440 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GATMP50440 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GATMP50440 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GATMP50440 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GATMP50440 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GATMP50440 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GATMP50440 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GATMP50440 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GATMP50440 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATMP50440 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATMP50440 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATMP50440 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATMP50440 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATMP50440 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATMP50440 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATMP50440 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATMP50440 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATMP50440 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATMP50440 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATMP50440 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATMP50440 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATMP50440 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GATMP50440 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATMP50440 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATMP50440 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATMP50440 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATMP50440 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATMP50440 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATMP50440 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATMP50440 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATMP50440 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATMP50440 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATMP50440 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATMP50440 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATMP50440 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATMP50440 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATMP50440 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATMP50440 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATMP50440 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATMP50440 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GATMP50440 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATMP50440 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATMP50440 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATMP50440 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATMP50440 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATMP50440 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATMP50440 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATMP50440 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATMP50440 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GATMP50440 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATMP50440 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GATMP50440 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GATMP50440 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GATMP50440 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GATMP50440 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GATMP50440 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms