Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRE11P49959 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRE11P49959 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRE11P49959 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRE11P49959 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRE11P49959 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRE11P49959 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRE11P49959 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRE11P49959 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRE11P49959 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRE11P49959 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRE11P49959 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRE11P49959 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRE11P49959 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRE11P49959 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRE11P49959 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRE11P49959 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRE11P49959 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRE11P49959 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRE11P49959 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRE11P49959 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRE11P49959 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRE11P49959 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRE11P49959 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRE11P49959 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MRE11P49959 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MRE11P49959 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRE11P49959 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRE11P49959 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRE11P49959 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRE11P49959 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRE11P49959 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRE11P49959 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRE11P49959 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRE11P49959 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRE11P49959 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRE11P49959 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRE11P49959 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRE11P49959 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MRE11P49959 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRE11P49959 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRE11P49959 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRE11P49959 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRE11P49959 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRE11P49959 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRE11P49959 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRE11P49959 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MRE11P49959 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MRE11P49959 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MRE11P49959 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MRE11P49959 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRE11P49959 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRE11P49959 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRE11P49959 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRE11P49959 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRE11P49959 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRE11P49959 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRE11P49959 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRE11P49959 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRE11P49959 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRE11P49959 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRE11P49959 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRE11P49959 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRE11P49959 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRE11P49959 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRE11P49959 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MRE11P49959 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRE11P49959 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRE11P49959 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRE11P49959 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRE11P49959 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRE11P49959 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRE11P49959 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRE11P49959 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRE11P49959 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRE11P49959 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRE11P49959 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRE11P49959 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRE11P49959 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRE11P49959 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRE11P49959 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MRE11P49959 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRE11P49959 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRE11P49959 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRE11P49959 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRE11P49959 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRE11P49959 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRE11P49959 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRE11P49959 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRE11P49959 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRE11P49959 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRE11P49959 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRE11P49959 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRE11P49959 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRE11P49959 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRE11P49959 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRE11P49959 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRE11P49959 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRE11P49959 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRE11P49959 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms