Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSEN2P49810 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms