Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RARRES1P49788 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARRES1P49788 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms