Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK8P49336 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK8P49336 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK8P49336 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK8P49336 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK8P49336 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK8P49336 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK8P49336 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK8P49336 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK8P49336 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK8P49336 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK8P49336 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK8P49336 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK8P49336 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK8P49336 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK8P49336 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK8P49336 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK8P49336 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK8P49336 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK8P49336 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK8P49336 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK8P49336 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK8P49336 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK8P49336 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK8P49336 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK8P49336 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK8P49336 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK8P49336 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK8P49336 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK8P49336 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK8P49336 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK8P49336 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK8P49336 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK8P49336 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK8P49336 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK8P49336 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK8P49336 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK8P49336 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK8P49336 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK8P49336 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK8P49336 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK8P49336 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK8P49336 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK8P49336 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK8P49336 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK8P49336 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK8P49336 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK8P49336 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK8P49336 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK8P49336 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK8P49336 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK8P49336 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK8P49336 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK8P49336 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK8P49336 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK8P49336 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK8P49336 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK8P49336 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK8P49336 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK8P49336 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK8P49336 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK8P49336 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK8P49336 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK8P49336 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK8P49336 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK8P49336 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK8P49336 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK8P49336 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK8P49336 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK8P49336 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK8P49336 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK8P49336 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK8P49336 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK8P49336 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK8P49336 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK8P49336 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK8P49336 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK8P49336 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK8P49336 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK8P49336 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK8P49336 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK8P49336 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK8P49336 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK8P49336 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK8P49336 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK8P49336 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK8P49336 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK8P49336 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK8P49336 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK8P49336 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK8P49336 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK8P49336 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK8P49336 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK8P49336 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK8P49336 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK8P49336 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK8P49336 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK8P49336 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK8P49336 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK8P49336 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms