Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNT3P45378 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms