Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR1P43307 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR1P43307 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR1P43307 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR1P43307 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR1P43307 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR1P43307 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR1P43307 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR1P43307 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR1P43307 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR1P43307 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR1P43307 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR1P43307 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR1P43307 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR1P43307 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR1P43307 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR1P43307 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR1P43307 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR1P43307 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR1P43307 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR1P43307 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR1P43307 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR1P43307 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR1P43307 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR1P43307 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR1P43307 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR1P43307 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR1P43307 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR1P43307 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR1P43307 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR1P43307 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR1P43307 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR1P43307 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR1P43307 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR1P43307 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR1P43307 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR1P43307 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR1P43307 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR1P43307 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR1P43307 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR1P43307 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR1P43307 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR1P43307 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR1P43307 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR1P43307 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSR1P43307 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSR1P43307 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSR1P43307 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSR1P43307 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSR1P43307 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSR1P43307 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSR1P43307 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSR1P43307 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSR1P43307 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSR1P43307 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSR1P43307 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SSR1P43307 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSR1P43307 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSR1P43307 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSR1P43307 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSR1P43307 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSR1P43307 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSR1P43307 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSR1P43307 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSR1P43307 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSR1P43307 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSR1P43307 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSR1P43307 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSR1P43307 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR1P43307 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR1P43307 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR1P43307 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR1P43307 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR1P43307 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR1P43307 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR1P43307 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR1P43307 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR1P43307 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR1P43307 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR1P43307 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR1P43307 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR1P43307 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR1P43307 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR1P43307 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR1P43307 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR1P43307 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SSR1P43307 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SSR1P43307 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR1P43307 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR1P43307 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR1P43307 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR1P43307 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR1P43307 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR1P43307 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR1P43307 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR1P43307 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR1P43307 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR1P43307 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR1P43307 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR1P43307 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms