Protein–RNA interactions for Protein: P40356

PGD1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PGD1P40356 TMA64YDR117C 1698 nt2.27□□□□□ -2.05
PGD1P40356 EXO70YJL085W 1872 nt2.26□□□□□ -2.05
PGD1P40356 ORC2YBR060C 1863 nt2.26□□□□□ -2.05
PGD1P40356 FAA2YER015W 2235 nt2.26□□□□□ -2.05
PGD1P40356 SAK1YER129W 3429 nt2.26□□□□□ -2.05
PGD1P40356 PHO2YDL106C 1680 nt2.26□□□□□ -2.05
PGD1P40356 PBS2YJL128C 2007 nt2.26□□□□□ -2.05
PGD1P40356 HTA1YDR225W 399 nt2.26□□□□□ -2.05
PGD1P40356 AIM11YER093C-A 414 nt2.26□□□□□ -2.05
PGD1P40356 KEG1YFR042W 603 nt2.26□□□□□ -2.05
PGD1P40356 PAU13YHL046C 363 nt2.26□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YIL024CYIL024C 570 nt2.26□□□□□ -2.05
PGD1P40356 RNH203YLR154C 333 nt2.26□□□□□ -2.05
PGD1P40356 MST28YAR033W 705 nt2.26□□□□□ -2.05
PGD1P40356 RDN58-1RDN58-1 158 nt2.26□□□□□ -2.05
PGD1P40356 RDN58-2RDN58-2 158 nt2.26□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YNR062CYNR062C 984 nt2.26□□□□□ -2.05
PGD1P40356 SPP381YBR152W 876 nt2.26□□□□□ -2.05
PGD1P40356 PKP2YGL059W 1476 nt2.26□□□□□ -2.05
PGD1P40356 RSM23YGL129C 1353 nt2.25□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YGL176CYGL176C 1665 nt2.25□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YCK2YNL154C 1641 nt2.25□□□□□ -2.05
PGD1P40356 BSC1YDL037C 987 nt2.25□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YGR039WYGR039W 312 nt2.25□□□□□ -2.05
PGD1P40356 AGE2YIL044C 897 nt2.25□□□□□ -2.05
PGD1P40356 ERG20YJL167W 1059 nt2.25□□□□□ -2.05
PGD1P40356 PIR1YKL164C 1026 nt2.25□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YKR070WYKR070W 1059 nt2.25□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YLL037WYLL037W 381 nt2.25□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt2.25□□□□□ -2.05
PGD1P40356 EAF7YNL136W 1278 nt2.25□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YNR068CYNR068C 819 nt2.25□□□□□ -2.05
PGD1P40356 snR42snR42 351 nt2.25□□□□□ -2.05
PGD1P40356 ARO4YBR249C 1113 nt2.25□□□□□ -2.05
PGD1P40356 MSB2YGR014W 3921 nt2.25□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YJR061WYJR061W 2808 nt2.25□□□□□ -2.05
PGD1P40356 GCD10YNL062C 1437 nt2.25□□□□□ -2.05
PGD1P40356 ARP8YOR141C 2646 nt2.24□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YDR535CYDR535C 501 nt2.24□□□□□ -2.05
PGD1P40356 GTT1YIR038C 705 nt2.24□□□□□ -2.05
PGD1P40356 SAS2YMR127C 1017 nt2.24□□□□□ -2.05
PGD1P40356 RUF20RUF20 443 nt2.24□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YNL184CYNL184C 327 nt2.24□□□□□ -2.05
PGD1P40356 snR11snR11 258 nt2.24□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YOR062CYOR062C 807 nt2.24□□□□□ -2.05
PGD1P40356 DAD3YBR233W-A 285 nt2.24□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YEF3YLR249W 3135 nt2.23□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YDL050CYDL050C 372 nt2.23□□□□□ -2.05
PGD1P40356 ARF1YDL192W 546 nt2.23□□□□□ -2.05
PGD1P40356 COX23YHR116W 456 nt2.23□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.23□□□□□ -2.05
PGD1P40356 SMA2YML066C 1110 nt2.23□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YMR187CYMR187C 1296 nt2.23□□□□□ -2.05
PGD1P40356 RPS10BYMR230W 318 nt2.23□□□□□ -2.05
PGD1P40356 LDH1YBR204C 1128 nt2.23□□□□□ -2.05
PGD1P40356 DNL4YOR005C 2835 nt2.23□□□□□ -2.05
PGD1P40356 NAB3YPL190C 2409 nt2.23□□□□□ -2.05
PGD1P40356 NEW1YPL226W 3591 nt2.23□□□□□ -2.05
PGD1P40356 RLI1YDR091C 1827 nt2.23□□□□□ -2.05
PGD1P40356 SEC26YDR238C 2922 nt2.23□□□□□ -2.05
PGD1P40356 SPH1YLR313C 1593 nt2.23□□□□□ -2.05
PGD1P40356 ECM18YDR125C 1362 nt2.23□□□□□ -2.05
PGD1P40356 RPO41YFL036W 4056 nt2.22□□□□□ -2.05
PGD1P40356 STE23YLR389C 3084 nt2.22□□□□□ -2.05
PGD1P40356 SVL3YPL032C 2478 nt2.22□□□□□ -2.05
PGD1P40356 RPS25AYGR027C 327 nt2.22□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YGR073CYGR073C 372 nt2.22□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YIL161WYIL161W 708 nt2.22□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YKL162CYKL162C 1209 nt2.22□□□□□ -2.05
PGD1P40356 BET3YKR068C 582 nt2.22□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YMR178WYMR178W 825 nt2.22□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YOR114WYOR114W 885 nt2.22□□□□□ -2.05
PGD1P40356 APD1YBR151W 951 nt2.22□□□□□ -2.05
PGD1P40356 TDA1YMR291W 1761 nt2.22□□□□□ -2.05
PGD1P40356 GIN4YDR507C 3429 nt2.22□□□□□ -2.05
PGD1P40356 TPO5YKL174C 1857 nt2.22□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YOL098CYOL098C 3114 nt2.21□□□□□ -2.06
PGD1P40356 VIP1YLR410W 3441 nt2.21□□□□□ -2.06
PGD1P40356 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.21□□□□□ -2.06
PGD1P40356 SDS3YIL084C 984 nt2.21□□□□□ -2.06
PGD1P40356 APC9YLR102C 798 nt2.21□□□□□ -2.06
PGD1P40356 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.21□□□□□ -2.06
PGD1P40356 JIP3YLR331C 378 nt2.21□□□□□ -2.06
PGD1P40356 POP8YBL018C 402 nt2.21□□□□□ -2.06
PGD1P40356 SYC1YOR179C 567 nt2.21□□□□□ -2.06
PGD1P40356 YKL222CYKL222C 2118 nt2.21□□□□□ -2.06
PGD1P40356 YCG1YDR325W 3108 nt2.21□□□□□ -2.06
PGD1P40356 DUN1YDL101C 1542 nt2.21□□□□□ -2.06
PGD1P40356 ROG1YGL144C 2058 nt2.21□□□□□ -2.06
PGD1P40356 LRG1YDL240W 3054 nt2.21□□□□□ -2.06
PGD1P40356 TLC1TLC1 1301 nt2.2□□□□□ -2.06
PGD1P40356 AI2Q0055 2565 nt2.2□□□□□ -2.06
PGD1P40356 YEL075CYEL075C 369 nt2.2□□□□□ -2.06
PGD1P40356 NSA2YER126C 786 nt2.2□□□□□ -2.06
PGD1P40356 SMX2YFL017W-A 234 nt2.2□□□□□ -2.06
PGD1P40356 ARI1YGL157W 1044 nt2.2□□□□□ -2.06
PGD1P40356 BRR6YGL247W 594 nt2.2□□□□□ -2.06
PGD1P40356 MPC3YGR243W 441 nt2.2□□□□□ -2.06
PGD1P40356 YMR087WYMR087W 855 nt2.2□□□□□ -2.06
PGD1P40356 TIF34YMR146C 1044 nt2.2□□□□□ -2.06
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