Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabra6P16305 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms