Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXD8P13378 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms