Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB1P11230 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB1P11230 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms