Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD3P0DMS9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms