Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2MP0CAP2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms