Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL1O95922 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms