Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD4O95243 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD4O95243 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD4O95243 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD4O95243 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD4O95243 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD4O95243 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD4O95243 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD4O95243 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD4O95243 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD4O95243 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD4O95243 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD4O95243 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD4O95243 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD4O95243 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD4O95243 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD4O95243 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD4O95243 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD4O95243 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD4O95243 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MBD4O95243 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD4O95243 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD4O95243 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD4O95243 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD4O95243 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD4O95243 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD4O95243 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD4O95243 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD4O95243 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD4O95243 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD4O95243 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MBD4O95243 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD4O95243 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD4O95243 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD4O95243 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD4O95243 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD4O95243 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD4O95243 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD4O95243 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD4O95243 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD4O95243 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD4O95243 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD4O95243 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD4O95243 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD4O95243 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD4O95243 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD4O95243 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD4O95243 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MBD4O95243 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD4O95243 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD4O95243 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD4O95243 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD4O95243 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD4O95243 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD4O95243 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD4O95243 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD4O95243 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD4O95243 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD4O95243 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD4O95243 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD4O95243 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MBD4O95243 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD4O95243 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD4O95243 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD4O95243 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD4O95243 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD4O95243 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD4O95243 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD4O95243 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD4O95243 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD4O95243 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD4O95243 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD4O95243 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD4O95243 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD4O95243 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MBD4O95243 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
MBD4O95243 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MBD4O95243 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MBD4O95243 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD4O95243 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD4O95243 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD4O95243 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD4O95243 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD4O95243 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD4O95243 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD4O95243 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD4O95243 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD4O95243 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD4O95243 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD4O95243 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD4O95243 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD4O95243 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD4O95243 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD4O95243 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD4O95243 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD4O95243 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD4O95243 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MBD4O95243 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MBD4O95243 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MBD4O95243 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms