Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBNO60934 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBNO60934 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBNO60934 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBNO60934 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBNO60934 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NBNO60934 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NBNO60934 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBNO60934 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBNO60934 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBNO60934 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NBNO60934 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBNO60934 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBNO60934 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBNO60934 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBNO60934 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBNO60934 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBNO60934 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBNO60934 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBNO60934 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBNO60934 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBNO60934 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBNO60934 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBNO60934 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBNO60934 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NBNO60934 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NBNO60934 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBNO60934 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBNO60934 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBNO60934 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NBNO60934 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBNO60934 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBNO60934 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBNO60934 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBNO60934 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBNO60934 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBNO60934 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBNO60934 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBNO60934 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBNO60934 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBNO60934 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NBNO60934 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBNO60934 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBNO60934 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NBNO60934 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBNO60934 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NBNO60934 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBNO60934 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NBNO60934 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NBNO60934 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NBNO60934 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBNO60934 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBNO60934 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBNO60934 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBNO60934 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBNO60934 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBNO60934 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBNO60934 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBNO60934 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NBNO60934 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBNO60934 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBNO60934 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NBNO60934 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBNO60934 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBNO60934 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NBNO60934 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBNO60934 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBNO60934 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NBNO60934 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBNO60934 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBNO60934 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBNO60934 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBNO60934 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBNO60934 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBNO60934 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBNO60934 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBNO60934 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NBNO60934 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBNO60934 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBNO60934 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NBNO60934 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBNO60934 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBNO60934 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBNO60934 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBNO60934 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBNO60934 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBNO60934 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBNO60934 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBNO60934 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBNO60934 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBNO60934 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBNO60934 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBNO60934 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBNO60934 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBNO60934 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBNO60934 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBNO60934 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBNO60934 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBNO60934 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBNO60934 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms