Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTNND1O60716 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNND1O60716 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNND1O60716 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNND1O60716 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNND1O60716 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNND1O60716 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNND1O60716 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNND1O60716 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNND1O60716 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTNND1O60716 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNND1O60716 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNND1O60716 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNND1O60716 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNND1O60716 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNND1O60716 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNND1O60716 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNND1O60716 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNND1O60716 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNND1O60716 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTNND1O60716 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms